C' à partir des années 1980 que le président de la société Benesse, Soichiro Fukutake, décida de transformer Naoshima en capitale de l’Art. Avec l’aide du célèbre architecte Tadao Ando, plusieurs musées et tous les bâtiments du vaste "Benesse Art Site" furent créés. Les bâtiments municipaux et les écoles, quant à eux, furent dessinés par l’architecte Kazuhiro Ishii.
Les œuvres sont exposées non seulement à l’intérieur du musée, mais aussi dans d’autres parties du bâtiment, le long de la côte et dans la forêt. Bénéficiant d'un climat ensoleillé de type méditerranéen et d'une atmosphère vouée au farniente, l'île dispose de plages de sable, qui attirent les touristes du monde entier.